1. مراقبة وتوثيق انتهاكات حقوق الإنسان:
تقوم وحدة البحث الميداني في المركز بهذه المهمة، من خلال طاقم من الباحثين الميدانيين الموزعين على مناطق مختلفة في قطاع غزة، يقومون برصد وتوثيق حالة حقوق الإنسان وجمع المعلومات اللازمة حول انتهاكات حقوق الإنسان في الأراضي الفلسطينية المحتلة، لا سيما الحقوق الاقتصادية والاجتماعية والثقافية، التي ترتكبها قوات الاحتلال الإسرائيلي من ناحية وجهات فلسطينية مسئولة من ناحية أخرى. وعلى سبيل المثال، قامت وحدة البحث الميداني خلال العام 2003 برصد وتوثيق 3.865 حالة انتهاك لحقوق الإنسان. وتوظف الوحدة هذه المعلومات الموثقة في الدفاع عن حقوق الإنسان بطرق مختلفة، مثل إحالة الضحايا إلى جهات الاختصاص، سواء داخل أو خارج المركز، ونشر التقارير الدورية لفضح انتهاكات حقوق الإنسان، وإتاحة المعلومات للمنظمات الأهلية والدولية العاملة في مجال حقوق الإنسان.

2. التوعية وبناء القدرات:
يسعى المركز إلى نشر الوعي بحقوق الإنسان وبناء قدرات المجتمع من خلال وحدتي التدريب والاتصال المجتمعي ووحدة المساعدة القانونية، وذلك من خلال برامجها المختلفة، وهي كالتالي:

-    الدورات التدريبية: التي تستهدف فئات مختلفة من المجتمع، تشمل العاملين في مجالات التعليم، والصحة، والتأهيل، والطلبة، ونشطاء حقوق الإنسان، والنساء، واللاجئين.

-    برنامج 'واجه الجمهور': وهو عبارة عن برنامج يتضمن عقد سلسلة لقاءات يتم فيها استضافة شخصيات عامة، وممثلين عن السلطة الوطنية الفلسطينية، والمجلس التشريعي، والحكومات المحلية، ومؤسسات الأمم المتحدة والمنظمات غير الحكومية، وغيرها، ودعوة فئات محددة من الجمهور من أجل طرح قضايا مجتمعية تتعلق بحقوق الإنسان، ونقاشها بشكل مباشر. ويشمل البرنامج آليات محددة لمتابعة القضايا المطروحة والعمل على حلها، وكذلك نشر وتعميم التجربة في أوساط المجتمع المختلفة. ويشكل هذا البرنامج مبادرة هامة لكونه يشجع المشاركة الشعبية في صنع القرار، والمساءلة والمحاسبة.

-    برنامج 'تعليم الأقران': وهو برنامج صمم خصيصاً لتثقيف طلبة الجامعات، وبموجبه تقوم مجموعات من طلاب الجامعات المتطوعين بنشر الوعي بحقوق الإنسان والديمقراطية داخل جامعاتهم، بعد أن يتم تجنيدهم وتدريبهم للقيام بهذا الدور. يقوم الطلاب المتطوعون بتنفيذ دورات تثقيفية تعتمد على أسلوب النقاش والحوار في الجامعات، يشارك فيها مئات الطلبة في كل عام.

-    ورشات العمل والندوات: وهي نشاطات يتم فيها تثقيف مجموعات مختلفة حول قضايا حقوق الإنسان، مثل أولياء الأمور، والمعلمين، والصحفيين، وغيرهم. كما يشمل برنامج ورشات العمل طرح قضايا تتعلق بالحقوق الاقتصادية والاجتماعية والثقافية بشكل متعمق، والخروج بتوصيات محددة ليتم متابعتها مع صناع القرار.

كما يشمل برنامج التوعية وبناء القدرات في المركز على مؤتمر سنوي حول موازنة السلطة الوطنية الفلسطينية  يهدف إلى تمهيد الطريق لتعزيز آليات أكثر شفافية في وضع الموازنة العامة، بناءً على الاحتياجات المجتمعية في كل قطاع. هذا و قد أصبح هذا المشروع في عام 2003 أحد المشاريع الأساسية للمركز، تقوم على تنفيذه وحدة المساعدة الفنية والتحشيد، بالتعاون مع الوحدات المختلفة.

3. المساعدة القانونية:
يقوم المركز، من خلال وحدة المساعدة القانونية، باستقبال شكاوى ضحايا انتهاكات حقوق الإنسان، وتمثيل المعتقلين في السجون الإسرائيلية، وسجون السلطة الوطنية الفلسطينية، والدفاع عن ضحايا مصادرة الأراضي، وتدمير المنازل، والمنع من السفر، بالإضافة إلى قضايا وشكاوى تتعلق بانتهاكات حقوق أساسية مثل العمل، والسكن، والتعليم والصحة، وغيرها من انتهاكات الحقوق الاقتصادية والاجتماعية. قامت وحدة المساعدة القانونية خلال الأعوام الماضية بمتابعة مئات القضايا التي تنطوي على انتهاكات لحقوق الإنسان  .

4. المراجعة القانونية:
من المهام الرئيسية الأخرى التي تقوم بها وحدة المساعدة القانونية، مراجعة مسودات القوانين الفلسطينية، للتأكد من مراعاتها لمعايير حقوق الإنسان، وتعزيز سيادة القانون في الأراضي الفلسطينية المحتلة. وذلك من خلال العمل مع المجلس التشريعي الفلسطيني وتقديم اقتراحات وبدائل أثناء سير العملية التشريعية.

5. البحث والتحليل:
يقوم المركز بتنفيذ نشاطات الرصد وإعداد الأبحاث والتقارير التحليلية للأوضاع الاقتصادية والاجتماعية والثقافية في قطاع غزة، من خلال وحد ة المساعدة الفنية والتحشيد، بالإضافة إلى العمل على تحليل موازنة السلطة الوطنية الفلسطينية، ووضع التوصيات للجهات المعنية بصنع القرار. كما تعمل على رفع مستوى الوعي في المجتمع المحلي بالحقوق الاقتصادية والاجتماعية والثقافية، والسياسات إلي تتبعها السلطة الوطنية الفلسطينية في وضع الميزانية، كأداة للتأكيد على تمتع الأفراد بتلك الحقوق. وتسعى هذه الوحدة على إلقاء الضوء على انتهاكات الحقوق الاقتصادية والاجتماعية والثقافية في الأراضي المحتلة، وتحليلها ونشر دراسات وتقارير حولها، وحشد الدعم المحلي والدولي والمحافظة على التواصل المستمر مع المنظمات والأجسام ذات العلاقة، من أجل ضمان حماية أفضل لهذه الحقوق.

6. التقارير والمطبوعات:
يشمل ذلك إصدار مواد قانونية مبسطة تشمل سلسلة الدليل، وهي عبارة عن دراسات مبسطة للقوانين الوطنية، تهدف إلى تزويد المواطن العادي بالمعرفة الأساسية والمبسطة حول القوانين والحقوق التي تتضمنها، والتقارير التوثيقية حول حالة حقوق الإنسان، ونشر الأبحاث والدراسات التحليلية، بالإضافة إلى الإصدارات حول وقائع الدورات التدريبية وورشات العمل المتنوعة التي ينفذها المركز، والتي تهدف إلى توثيق وتعميم التجارب. ويقو م المركز بإعداد بيانات مشتركة مع مؤسسات زميلة، وتقارير توثيقية، وتقارير خاصة، وبيانات صحفية حول انتهاكات حقوق الإنسان

7. المكتبة:
أنشأ المركز، في مقره الرئيس في مخيم جباليا للاجئين، مكتبة تضم آلاف الكتب والمراجع والمصادر وأوعية معلومات تتعلق بحقوق الإنسان، والتنمية، والجندر، والسياسة، وغيرها من الموضوعات ذات الصلة. وتتاح خدمات المكتبة لجميع سكان منطقة شمال غزة، وغيرهم من الباحثين، والمهتمين. و ينتظر من هذه المكتبة أن تسهم في نشر الوعي و الثقافة بحقوق الإنسان في هذه المنطقة، التي تفتقر إلى خدمات المكتبة.